Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tff2Q03404 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms