Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mmp11Q02853 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms