Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Htr1fQ02284 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms