Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnb1Q02248 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms