Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VcpQ01853 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VcpQ01853 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VcpQ01853 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VcpQ01853 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VcpQ01853 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms