Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mc1rQ01727 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms