Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec23aQ01405 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms