Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HmgcrQ01237 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms