Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2cQ01098 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 550 ms