Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Grin2bQ01097 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Grin2bQ01097 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms