Protein–RNA interactions for Protein: Q00941

Csf2ra, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2raQ00941 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csf2raQ00941 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf2raQ00941 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms