Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb4P99026 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb4P99026 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb4P99026 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb4P99026 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb4P99026 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psmb4P99026 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psmb4P99026 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psmb4P99026 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb4P99026 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms