Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfdP97946 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfdP97946 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfdP97946 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfdP97946 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfdP97946 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfdP97946 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfdP97946 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms