Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IhhP97812 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IhhP97812 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IhhP97812 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IhhP97812 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IhhP97812 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IhhP97812 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IhhP97812 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IhhP97812 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IhhP97812 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IhhP97812 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IhhP97812 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IhhP97812 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IhhP97812 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IhhP97812 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IhhP97812 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IhhP97812 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IhhP97812 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IhhP97812 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IhhP97812 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IhhP97812 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IhhP97812 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IhhP97812 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IhhP97812 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IhhP97812 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IhhP97812 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IhhP97812 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IhhP97812 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IhhP97812 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IhhP97812 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IhhP97812 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IhhP97812 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IhhP97812 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IhhP97812 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IhhP97812 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IhhP97812 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IhhP97812 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IhhP97812 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IhhP97812 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IhhP97812 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IhhP97812 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IhhP97812 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IhhP97812 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IhhP97812 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IhhP97812 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IhhP97812 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IhhP97812 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IhhP97812 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IhhP97812 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IhhP97812 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IhhP97812 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IhhP97812 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IhhP97812 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IhhP97812 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IhhP97812 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IhhP97812 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IhhP97812 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IhhP97812 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IhhP97812 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IhhP97812 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IhhP97812 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IhhP97812 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IhhP97812 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IhhP97812 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IhhP97812 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IhhP97812 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IhhP97812 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IhhP97812 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IhhP97812 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IhhP97812 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IhhP97812 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IhhP97812 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IhhP97812 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IhhP97812 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IhhP97812 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IhhP97812 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IhhP97812 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IhhP97812 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IhhP97812 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IhhP97812 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IhhP97812 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IhhP97812 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IhhP97812 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IhhP97812 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IhhP97812 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IhhP97812 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IhhP97812 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IhhP97812 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IhhP97812 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IhhP97812 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
IhhP97812 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IhhP97812 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IhhP97812 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IhhP97812 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IhhP97812 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IhhP97812 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IhhP97812 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IhhP97812 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IhhP97812 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IhhP97812 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms