Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AlkP97793 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AlkP97793 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AlkP97793 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AlkP97793 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
AlkP97793 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AlkP97793 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AlkP97793 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AlkP97793 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AlkP97793 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AlkP97793 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AlkP97793 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AlkP97793 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AlkP97793 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AlkP97793 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AlkP97793 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
AlkP97793 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
AlkP97793 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AlkP97793 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AlkP97793 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
AlkP97793 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AlkP97793 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AlkP97793 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AlkP97793 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AlkP97793 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AlkP97793 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AlkP97793 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AlkP97793 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AlkP97793 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AlkP97793 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AlkP97793 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AlkP97793 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AlkP97793 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AlkP97793 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AlkP97793 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AlkP97793 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AlkP97793 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AlkP97793 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AlkP97793 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AlkP97793 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AlkP97793 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AlkP97793 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AlkP97793 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AlkP97793 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AlkP97793 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AlkP97793 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AlkP97793 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AlkP97793 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AlkP97793 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AlkP97793 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AlkP97793 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AlkP97793 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AlkP97793 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AlkP97793 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
AlkP97793 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AlkP97793 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AlkP97793 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
AlkP97793 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AlkP97793 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AlkP97793 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AlkP97793 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AlkP97793 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AlkP97793 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AlkP97793 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AlkP97793 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AlkP97793 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AlkP97793 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AlkP97793 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AlkP97793 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25■■□□□ 1.59
AlkP97793 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AlkP97793 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AlkP97793 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AlkP97793 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AlkP97793 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AlkP97793 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AlkP97793 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AlkP97793 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AlkP97793 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AlkP97793 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AlkP97793 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
AlkP97793 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AlkP97793 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AlkP97793 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AlkP97793 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AlkP97793 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AlkP97793 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AlkP97793 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AlkP97793 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AlkP97793 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AlkP97793 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AlkP97793 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AlkP97793 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AlkP97793 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AlkP97793 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AlkP97793 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AlkP97793 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AlkP97793 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AlkP97793 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AlkP97793 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AlkP97793 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms