Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmklr1P97468 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmklr1P97468 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms