Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1b3P97370 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp1b3P97370 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b3P97370 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b3P97370 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b3P97370 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b3P97370 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b3P97370 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b3P97370 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b3P97370 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms