Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mesp1P97309 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mesp1P97309 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mesp1P97309 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mesp1P97309 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mesp1P97309 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mesp1P97309 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mesp1P97309 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mesp1P97309 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mesp1P97309 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mesp1P97309 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mesp1P97309 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mesp1P97309 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mesp1P97309 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mesp1P97309 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mesp1P97309 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mesp1P97309 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mesp1P97309 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mesp1P97309 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mesp1P97309 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mesp1P97309 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mesp1P97309 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mesp1P97309 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mesp1P97309 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mesp1P97309 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mesp1P97309 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mesp1P97309 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mesp1P97309 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mesp1P97309 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mesp1P97309 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mesp1P97309 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mesp1P97309 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mesp1P97309 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mesp1P97309 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mesp1P97309 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mesp1P97309 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mesp1P97309 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mesp1P97309 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mesp1P97309 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mesp1P97309 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mesp1P97309 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mesp1P97309 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mesp1P97309 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mesp1P97309 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mesp1P97309 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mesp1P97309 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mesp1P97309 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mesp1P97309 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mesp1P97309 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mesp1P97309 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mesp1P97309 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mesp1P97309 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mesp1P97309 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mesp1P97309 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mesp1P97309 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mesp1P97309 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mesp1P97309 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mesp1P97309 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mesp1P97309 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mesp1P97309 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mesp1P97309 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mesp1P97309 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Mesp1P97309 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mesp1P97309 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mesp1P97309 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mesp1P97309 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mesp1P97309 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mesp1P97309 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Mesp1P97309 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms