Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NyxP83503 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NyxP83503 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NyxP83503 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NyxP83503 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NyxP83503 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NyxP83503 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NyxP83503 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NyxP83503 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NyxP83503 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NyxP83503 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NyxP83503 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NyxP83503 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NyxP83503 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NyxP83503 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NyxP83503 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NyxP83503 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NyxP83503 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NyxP83503 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NyxP83503 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NyxP83503 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NyxP83503 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NyxP83503 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NyxP83503 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NyxP83503 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NyxP83503 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NyxP83503 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NyxP83503 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NyxP83503 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NyxP83503 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NyxP83503 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NyxP83503 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NyxP83503 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NyxP83503 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NyxP83503 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NyxP83503 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NyxP83503 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NyxP83503 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NyxP83503 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NyxP83503 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NyxP83503 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NyxP83503 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NyxP83503 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NyxP83503 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NyxP83503 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NyxP83503 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NyxP83503 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NyxP83503 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NyxP83503 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NyxP83503 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NyxP83503 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NyxP83503 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NyxP83503 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NyxP83503 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NyxP83503 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NyxP83503 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NyxP83503 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NyxP83503 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NyxP83503 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NyxP83503 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NyxP83503 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NyxP83503 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NyxP83503 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NyxP83503 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NyxP83503 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NyxP83503 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NyxP83503 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NyxP83503 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NyxP83503 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NyxP83503 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NyxP83503 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NyxP83503 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NyxP83503 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NyxP83503 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NyxP83503 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NyxP83503 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NyxP83503 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NyxP83503 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NyxP83503 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NyxP83503 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NyxP83503 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NyxP83503 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NyxP83503 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NyxP83503 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NyxP83503 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NyxP83503 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NyxP83503 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NyxP83503 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NyxP83503 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NyxP83503 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NyxP83503 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NyxP83503 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NyxP83503 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NyxP83503 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NyxP83503 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NyxP83503 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NyxP83503 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NyxP83503 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NyxP83503 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NyxP83503 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms