Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Polr1bP70700 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms