Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shox2P70390 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shox2P70390 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shox2P70390 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shox2P70390 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shox2P70390 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shox2P70390 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shox2P70390 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Shox2P70390 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shox2P70390 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shox2P70390 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shox2P70390 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms