Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chl1P70232 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chl1P70232 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chl1P70232 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chl1P70232 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chl1P70232 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chl1P70232 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chl1P70232 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chl1P70232 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chl1P70232 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chl1P70232 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chl1P70232 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chl1P70232 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chl1P70232 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Chl1P70232 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chl1P70232 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms