Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb4bP68372 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms