Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barhl1P63157 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Barhl1P63157 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms