Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps13P62301 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps13P62301 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps13P62301 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps13P62301 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps13P62301 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms