Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg6P61406 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg6P61406 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg6P61406 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg6P61406 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smg6P61406 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg6P61406 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg6P61406 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smg6P61406 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smg6P61406 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smg6P61406 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms