Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ActbP60710 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ActbP60710 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ActbP60710 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ActbP60710 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ActbP60710 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ActbP60710 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ActbP60710 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ActbP60710 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ActbP60710 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ActbP60710 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ActbP60710 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ActbP60710 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ActbP60710 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ActbP60710 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ActbP60710 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ActbP60710 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ActbP60710 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ActbP60710 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ActbP60710 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ActbP60710 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ActbP60710 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ActbP60710 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ActbP60710 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ActbP60710 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ActbP60710 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ActbP60710 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ActbP60710 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ActbP60710 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ActbP60710 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ActbP60710 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ActbP60710 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ActbP60710 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ActbP60710 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ActbP60710 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ActbP60710 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ActbP60710 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ActbP60710 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ActbP60710 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ActbP60710 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ActbP60710 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ActbP60710 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ActbP60710 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ActbP60710 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ActbP60710 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ActbP60710 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ActbP60710 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ActbP60710 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ActbP60710 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ActbP60710 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ActbP60710 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ActbP60710 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ActbP60710 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ActbP60710 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ActbP60710 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ActbP60710 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ActbP60710 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ActbP60710 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ActbP60710 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms