Protein–RNA interactions for Protein: P60122

Ruvbl1, RuvB-like 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ruvbl1P60122 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ruvbl1P60122 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ruvbl1P60122 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ruvbl1P60122 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ruvbl1P60122 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ruvbl1P60122 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ruvbl1P60122 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ruvbl1P60122 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ruvbl1P60122 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ruvbl1P60122 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ruvbl1P60122 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ruvbl1P60122 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ruvbl1P60122 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ruvbl1P60122 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ruvbl1P60122 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ruvbl1P60122 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ruvbl1P60122 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ruvbl1P60122 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ruvbl1P60122 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ruvbl1P60122 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ruvbl1P60122 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ruvbl1P60122 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms