Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Rin3P59729 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rin3P59729 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rin3P59729 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms