Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup43P59235 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup43P59235 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup43P59235 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup43P59235 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup43P59235 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup43P59235 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup43P59235 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup43P59235 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup43P59235 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms