Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhbdl3P58873 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rhbdl3P58873 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rhbdl3P58873 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Rhbdl3P58873 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhbdl3P58873 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhbdl3P58873 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhbdl3P58873 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhbdl3P58873 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhbdl3P58873 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhbdl3P58873 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms