Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Paxbp1P58501 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms