Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpdl3bP58242 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpdl3bP58242 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms