Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdaP56389 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CdaP56389 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CdaP56389 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CdaP56389 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CdaP56389 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CdaP56389 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdaP56389 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdaP56389 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdaP56389 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdaP56389 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdaP56389 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdaP56389 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdaP56389 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdaP56389 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdaP56389 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdaP56389 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdaP56389 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdaP56389 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdaP56389 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdaP56389 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdaP56389 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdaP56389 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdaP56389 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdaP56389 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdaP56389 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdaP56389 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdaP56389 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdaP56389 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdaP56389 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdaP56389 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdaP56389 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdaP56389 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdaP56389 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdaP56389 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdaP56389 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CdaP56389 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdaP56389 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdaP56389 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdaP56389 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdaP56389 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdaP56389 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdaP56389 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdaP56389 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdaP56389 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdaP56389 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdaP56389 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdaP56389 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdaP56389 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdaP56389 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdaP56389 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdaP56389 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdaP56389 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CdaP56389 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CdaP56389 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdaP56389 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdaP56389 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdaP56389 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CdaP56389 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CdaP56389 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdaP56389 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdaP56389 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdaP56389 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdaP56389 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdaP56389 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdaP56389 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdaP56389 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdaP56389 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdaP56389 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CdaP56389 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdaP56389 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CdaP56389 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdaP56389 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdaP56389 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdaP56389 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdaP56389 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms