Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.1 ms