Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Faf1P54731 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Faf1P54731 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Faf1P54731 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Faf1P54731 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Faf1P54731 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms