Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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