Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SftpdP50404 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SftpdP50404 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SftpdP50404 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SftpdP50404 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SftpdP50404 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SftpdP50404 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SftpdP50404 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SftpdP50404 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SftpdP50404 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SftpdP50404 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SftpdP50404 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SftpdP50404 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpdP50404 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms