Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rfx2P48379 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms