Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpiaP47968 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpiaP47968 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpiaP47968 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpiaP47968 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpiaP47968 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpiaP47968 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpiaP47968 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpiaP47968 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpiaP47968 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms