Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl5P47962 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms