Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf1P46099 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf1P46099 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf1P46099 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf1P46099 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf1P46099 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf1P46099 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf1P46099 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf1P46099 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf1P46099 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms