Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf4P43488 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms