Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NodalP43021 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NodalP43021 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NodalP43021 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NodalP43021 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NodalP43021 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NodalP43021 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NodalP43021 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NodalP43021 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NodalP43021 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NodalP43021 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NodalP43021 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NodalP43021 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NodalP43021 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NodalP43021 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NodalP43021 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NodalP43021 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NodalP43021 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NodalP43021 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NodalP43021 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NodalP43021 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NodalP43021 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NodalP43021 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NodalP43021 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NodalP43021 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NodalP43021 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NodalP43021 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NodalP43021 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NodalP43021 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NodalP43021 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NodalP43021 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NodalP43021 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NodalP43021 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NodalP43021 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NodalP43021 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NodalP43021 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NodalP43021 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NodalP43021 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NodalP43021 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NodalP43021 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NodalP43021 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NodalP43021 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NodalP43021 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NodalP43021 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NodalP43021 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NodalP43021 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms