Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cap1P40124 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cap1P40124 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cap1P40124 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cap1P40124 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cap1P40124 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cap1P40124 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cap1P40124 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms