Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik2P39087 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik2P39087 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grik2P39087 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik2P39087 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik2P39087 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik2P39087 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik2P39087 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik2P39087 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms