Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rom1P32958 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rom1P32958 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rom1P32958 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rom1P32958 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rom1P32958 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rom1P32958 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rom1P32958 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rom1P32958 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rom1P32958 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rom1P32958 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rom1P32958 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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