Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd8P29595 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms