Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NapbP28663 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NapbP28663 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
NapbP28663 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NapbP28663 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NapbP28663 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NapbP28663 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NapbP28663 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NapbP28663 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NapbP28663 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NapbP28663 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NapbP28663 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NapbP28663 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NapbP28663 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NapbP28663 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NapbP28663 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NapbP28663 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NapbP28663 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NapbP28663 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NapbP28663 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NapbP28663 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NapbP28663 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NapbP28663 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NapbP28663 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NapbP28663 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NapbP28663 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NapbP28663 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NapbP28663 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NapbP28663 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NapbP28663 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NapbP28663 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NapbP28663 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NapbP28663 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NapbP28663 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NapbP28663 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NapbP28663 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NapbP28663 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NapbP28663 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NapbP28663 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NapbP28663 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NapbP28663 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NapbP28663 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NapbP28663 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NapbP28663 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NapbP28663 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NapbP28663 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NapbP28663 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NapbP28663 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NapbP28663 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NapbP28663 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NapbP28663 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NapbP28663 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NapbP28663 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NapbP28663 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NapbP28663 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NapbP28663 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NapbP28663 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NapbP28663 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NapbP28663 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NapbP28663 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NapbP28663 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NapbP28663 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NapbP28663 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NapbP28663 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NapbP28663 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NapbP28663 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NapbP28663 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NapbP28663 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NapbP28663 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NapbP28663 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NapbP28663 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NapbP28663 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NapbP28663 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NapbP28663 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NapbP28663 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NapbP28663 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NapbP28663 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NapbP28663 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NapbP28663 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NapbP28663 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NapbP28663 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NapbP28663 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NapbP28663 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NapbP28663 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NapbP28663 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NapbP28663 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NapbP28663 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NapbP28663 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NapbP28663 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NapbP28663 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NapbP28663 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NapbP28663 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NapbP28663 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NapbP28663 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NapbP28663 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NapbP28663 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NapbP28663 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NapbP28663 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NapbP28663 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NapbP28663 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms