Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Apex1P28352 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apex1P28352 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Apex1P28352 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apex1P28352 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apex1P28352 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Apex1P28352 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Apex1P28352 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apex1P28352 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apex1P28352 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms